光阴似箭，转眼又过去三年多，这一年忍界又发生了很多事。
首先是迈特凯与归海小桃生下了一个女儿，其次就是岩隐村、雾隐村、与岩隐村这三大隐村终于按捺不住了，他们对涡之国发起了突袭，可怜涡之国在木叶任何防备的情况被三大隐村打得岌岌可危。
第二次忍界大战正式爆发，木叶在得知涡之国被袭击后，也召开了紧急会议，可是由于云隐村与岩隐村都陈兵于火之国的边境，木叶村为了应对这次危机，他们自然派不出多少兵力前去营救。
不仅如此，岩隐村甚至已经派出了还派出了不少忍者小队入侵火之国，至于砂隐村也木叶闲着，他们虽然木叶入侵火之国，但是他们却大势入侵川之国于雨之国。
川之国由于没有自家的隐村，他们的反抗就显得非常微弱，川之国的大名也不想静待等死，他连忙朝火之国大名求救，火之国大名也为了消弱没有的力量而答应了川之国大名的要求。
此时的木叶早就不是之前的木叶了，三代火影猿飞日斩由于自身实力不够，他在面对火之国大名的无理要求的时候，就有些举棋不定。
木叶高层们在经过权衡利弊后，他们妥协了。
至于雨之国，他们有自已的隐村，因此他们在面对砂隐村的进攻的时候，他们还可以拖住砂隐村的一部分兵力，再加上雨之国的特殊环境，水之国的傀儡部队受限非常严重。
涡之国由于苦等不来木叶的援军，最后涡之国自然被灭国了，残存的涡朝村忍者最后不得不隐姓埋名流亡于忍界。
可惜追杀他们的忍者却不想放过他们，他们很多人都在逃亡的过程中被各方势力追杀致死。
即使有少部分人逃脱了追杀，他们也不敢再以漩涡族人自居。
漩涡水户对于木叶高层的不作为，很是不满，但是她也知道这怪不得木叶高层，毕竟忍界的选择的形势根本不容许木叶派出大量的忍者前去救援。
当然，木叶也不是没有派人前去救援，只不过他们派去的人实在是太少，要不纲手等千手一族的忍者拼尽全力，他们甚至都不可能把漩涡一族的绝大部分封印术给抢夺回来。
是的，是抢夺回来。
由于木叶实在是没有太多人手可用，于是木叶派出了少量的高手前去帮助漩涡一族，只不过他们根本就没能力救人，于是他们选择了抢夺其他三大隐村的战利品。
涡之国被灭后，忍界的形势一天不如一天，没多久雨之国的首领山椒鱼半藏，在各大隐村肆意践踏雨之国的尊严后，彻底的爆发了。
雨隐村首领山椒鱼半藏突然率领雨隐村攻占了雨之国的大名府，他直接抢夺了雨之国的政权。
随着他抢夺了雨之国的争取后，雨隐村在获得雨之国的大量资金虎，山椒鱼半藏利用整个雨之国的资金开始疯狂的培养忍者，在大量资金的帮助下，雨之国的忍者发展非常迅猛，短短一年左右，雨之国的忍者数量就以得到数倍的增长。
这是很可怕的，雨之国雨隐村本只是一个小隐村，但是随着山椒鱼半藏把整个雨之国的财力都用于培养速成忍者，雨隐村的实力已经不下于汤之国的汤隐村了。
本来到了这个时候，五大隐村是不可能坐等雨隐村壮大的，可是由于五大隐村相互牵制，雨之国雨隐村借机继续做大做强，他们甚至都开始向铁之国伸出爪牙。
铁之国大将为了自保，他们也不得不再次面临忍者，不过现实又狠狠的给了他们一击，铁之国的武士竟然在短短半年内就被雨隐村击败了。
铁之国的大将被山椒鱼半藏斩杀，铁之国大将继承人三船也被山椒鱼半藏重伤，铁之国大名见状不得不出面求和，然后为雨隐村提供大量的精铁与资金。
雨之国击败铁之国后，五大隐村还在相互较劲，他们不断派出忍者小队对其他四大隐村所属的据点进行破坏，企图把战火烧到对方的领土内。等五大隐村反应过来的时候，雨隐村的实力又有了非常大的提升。
五大隐村这个时候族人不可能再看着雨隐村继续扩充实力，就在他们要对雨隐村下手的时候，雨之国雨隐村首领山椒鱼半藏却抢先他们一步，他正是向五大隐村宣战。
山椒鱼半藏的狂妄之语，起初并没有被五大隐村放在心上，可是随着各大隐村在与山椒鱼半藏领导下的雨隐村短兵相接后，五大隐村才发现山椒鱼半藏的可怕。
山椒鱼半藏不仅有影级的实力，他还非常善于用毒，五大隐村在与雨隐村的大战中都被山椒鱼半藏给狠狠上了一课。
他们的忍者在雨之国的特殊环境下，被山椒鱼半藏给毒死不少。
这突如其来的变故让各大隐村都开始注重用毒与解毒，这其中以木叶与砂隐村尤为突出。
木叶由于有千手一族这个擅长医疗忍术的族群，隐村木叶在解毒这方面格外突出。
砂隐村则因为他们受居住环境与他们大量装备傀儡的关系，他们对毒的了解远超其他隐村。
砂隐村的解毒能力虽然没有木叶那么强，但是由于他们也比较擅长用毒，因此他们的损失反而更小的。
由于这次大战前期雨隐村战绩非常大的优势，因此山椒鱼半藏被各大隐村戏称为当前最强，他也因此被五大隐村的高层戏称为‘半神’。
五大隐村这个时候也不敢冒然的对雨隐村进行围剿了，因此他们不断派忍者潜入雨之国对雨之国的进行破坏。
随着五大隐村不断对着雨之国的破坏越来越严重，被雨之国打下来的各个地区也被策反，其中最为致命的就是铁之国在五大隐村的帮助下，也摆脱雨隐村的控制，则导致雨隐村的经济形势直线下滑。
雨之国的忍者的物资与财力供应也被打断，雨隐村首领那车i为忍界第六大国的美梦也随之破灭。
山椒鱼半藏自然不甘心之前的努力付之东流，他连忙对雨之国境内进行了大清洗，大量的五大隐村的忍者被他剿灭，随着而来的就是短暂的平衡与和平。
