学院保卫战的胜利并没有让林宇等人有太多喘息的机会，战争留下的创伤需要时间去修复，而暗影联盟虽暂时退去，却犹如一颗随时可能引爆的炸弹，依旧威胁着银河系的和平。
林宇和他的伙伴们协助学院的教职员工展开了大规模的重建工作。星舰需要修复和升级，防御系统要进一步强化，还有受伤的学员和教官急需救治与心理安抚。林宇在忙碌中不忘反思战斗中的不足，他深知暗影联盟不会再次以同样的方式进攻，下一次交锋必然更加凶险。
在重建过程中，一个意外的发现让众人忧心忡忡。艾娃在检查被击落的暗影联盟战斗机残骸时，发现了一种未知的能量信号残留，这种信号似乎与一种古老而邪恶的宇宙力量有所关联。她将此事告知林宇和其他伙伴后，大家决定深入研究。
他们在学院的科研实验室中，借助先进的仪器对这种能量信号进行分析。经过数天的艰苦努力，终于有了一些头绪。这种能量信号来源于一种被称为“幽影之力”的黑暗能量，它能够侵蚀生物的心智，控制他们的行为，并且可以强化武器和战舰的性能。
“如果暗影联盟大规模运用这种幽影之力，那后果不堪设想。”雷克斯皱着眉头说道。
林宇表情凝重：“我们必须找到应对幽影之力的方法，否则银河系将陷入万劫不复之地。”
就在他们研究幽影之力时，学院收到了来自银河系各个星球的求救信号。原来，暗影联盟在进攻学院失败后，转而对其他星球发动了更为残酷的袭击。这些星球没有星耀学院的防御力量和技术支持，在暗影联盟的攻击下迅速沦陷，无数生命在幽影之力的笼罩下痛苦挣扎。
林宇等人看着这些求救信号，心急如焚。他们请求校长卡尔批准他们前往救援，但校长却面露难色。学院的力量在之前的战斗中已经遭受重创，此时若再派出他们冒险，一旦失败，学院将失去最后的防线。
然而，林宇的一番话打动了校长：“校长，我们是银河系的守护者，如果现在我们因为害怕而退缩，那之前的战斗就毫无意义。我们会在救援的同时，寻找对抗幽影之力的方法，为彻底击败暗影联盟奠定基础。”
校长卡尔沉思良久，最终同意了他们的请求。林宇、雷克斯、艾娃和凯隐挑选了学院中状态较好的星舰和一些勇敢的学员，组成了救援舰队，踏上了征程。
他们首先抵达了一颗名为绿星的星球。绿星原本是一个充满生机的星球，有着广袤的森林和清澈的湖泊。但如今，这里被黑暗笼罩，城市化为废墟，居民们眼神呆滞地在街道上徘徊，被幽影之力完全控制。
林宇等人驾驶星舰在绿星上空盘旋，试图寻找解救居民的方法。艾娃尝试用精神力去驱散居民体内的幽影之力，但发现这种力量极为顽固，一旦强行驱散，可能会对居民的大脑造成永久性损伤。
雷克斯提出：“我们先找到暗影联盟在绿星的控制中心，摧毁它，也许就能切断幽影之力的来源。”
于是，他们驾驶星舰在绿星上展开搜索。在寻找过程中，他们遭遇了被幽影之力控制的绿星军队的攻击。这些曾经保卫绿星的战士如今成为了敌人的傀儡，朝着他们疯狂开火。
林宇等人无奈之下，只能一边躲避攻击，一边继续寻找控制中心。凯隐通过分析能量波动，发现控制中心位于绿星的地下深处，那里被一层强大的能量护盾保护着。
为了突破护盾，林宇决定再次尝试融合星灵导航与星核之力。他集中精力，将两种力量汇聚到星舰的能量破甲装置上。在一阵耀眼的光芒中，星舰成功突破了护盾，进入了地下控制中心。
在控制中心内，他们与暗影联盟的守军展开了激烈的战斗。林宇凭借着强大的力量，在战斗中逐渐接近控制中心的核心装置。他发现这个核心装置就是幽影之力的散发源，只要摧毁它，就能解救绿星的居民。
但就在他即将摧毁核心装置时，一道幽影之力的攻击朝他袭来。艾娃及时赶到，用自已的身体为林宇挡住了这一击。艾娃倒在林宇的怀里，脸色苍白，生命气息逐渐微弱。
“艾娃！”林宇悲痛欲绝，他愤怒地转身，将所有的力量都倾注到对核心装置的攻击上。在雷克斯和凯隐的配合下，最终成功摧毁了核心装置。
随着核心装置的毁灭，绿星上的幽影之力逐渐消散，居民们也慢慢恢复了意识。但艾娃的伤势却极为严重，林宇抱着她迅速返回星舰，朝着星耀学院疾驰而去，希望能在学院的医疗技术下挽救艾娃的生命。而他们的救援之旅才刚刚开始，暗影联盟的威胁依然笼罩着整个银河系，他们必须尽快找到彻底对抗幽影之力的方法，才能拯救更多的生命和星球。
